O Museu Bode foi inaugurado em 1904 com o nome de Museu Kaiser Friedrich, em homenagem ao imperador Friedrich III. Em 1956, o museu recebeu, então, o nome de seu primeiro diretor (Wilhelm von Bode), que ficou conhecido por suas exposições criativas, mesclando as exposições e os períodos históricos e montando vitrines com seus temas pessoais.

O edifício foi projetado por Ernst von Ihne e parece estar emergindo diretamente do Rio Spree. Ele foi muito danificado durante a guerra e a restauração da sua beleza original demorou muitos anos. Uma reforma substancial começou em 1997 e continuou até o novo milênio.

Atualmente, a coleção de esculturas do museu apresenta grandes peças de arte do Oriente cristão, esculturas e peças da Idade Média, arte da era gótica italiana e do início do Renascimento, só para citar algumas das exposições em destaque do museu.

Uma coleção de Numismática foi aberta ao público em 2004, no 100º aniversário da inauguração do museu, e é até hoje uma das maiores e mais conhecidas coleções de moedas do mundo.